More s obalom proglašeno je ekološki važnim područjem i dom je čak 1.800 različitih biljnih i životinjskih vrsta. Morska kornjača kareta i velika pliskavica (dupin) stalni su stanovnici našeg mora.

U zaljevu je i posebno ekološki važno područje: stanište posidonije .

Između Kopra i Izole nalazi se i drvored pinija, a pored Žusterne primijetit ćete još jednu posebnost koja je ocijenjena kao prirodna vrijednost, i to flišni klif.