A tenger és partvidéke ökológiai szempontból fontos terület és 1800-féle növény- és állatfajnak ad otthont. Itt él például a súlyosan veszélyeztetett közönséges cserepesteknős. Tengerünk lakója a delfin is.
Az öbölben található a posidonia nevű neptunfű kiemelt természetvédelmi övezetté nyilvánított élőhelye.
Koper és Izola között fekszik egy szép fenyő fasor, Žusternában pedig egy természeti értéknek nyilvánított flysch sziklameredély várja a látogatókat.