A jelenlegi templom állítólag a 11. században épült, azóta többször újjáépítették. Az alsó rész gótikus, a felső rész reneszánsz stílusban épült. A 18. század első felében kibővítették a székesegyházat. Ma a székesegyház templomát az egyik legnagyobbnak tartják Szlovéniában. Hossza 70 méter, szélessége 25 méter.
A templomban megtekinthetők Vittore Carpaccia műalkotásai és Szt. Nazarénusz, a város védőszentje és Koper püspöke (a 6. századból) sírköve, amelyet a Velencei Köztársaság adományozott a városnak 1350 körül.
A Koper-székesegyház különlegessége a keresztelőkápolna – a Carmel-i Isten Szűz Anyja kör alakú rotundája, amely elválasztott a templomtól.
A templom mellett egy 54 méter magas 12. századi harangtorony áll, amelyet 1488-ban csatlakoztattak a székesegyházhoz.
A katedrálisban található egy csodálatos 4 manuális szimfonikus orgona is, amely Szlovénia legnagyobb templomi orgonája. 1988-ban a német Kleuker és Steinmeyer orgonaműhelyek készítettek Jean Guillo (1930-2019) francia zeneszerző, orgonaművész, zongoraművész és pedagógus tervei alapján.
