Capodistria dispone di buoni collegamenti nazionali (ad esempio con le città dell’Istria slovena e con Lubiana) e internazionali (ad esempio con le città vicine in Italia e Croazia).
La stazione principale degli autobus di Capodistria (indirizzo: Kolodvorska cesta 11, si trova a soli 20 minuti a piedi dal centro città. Gli autobus urbani collegano il centro e varie altre località della città. Vicino alla stazione degli autobus si trovano anche una stazione dei taxi e un parcheggio P&R (park and ride).
Le compagnie di autobus che operano nell’area di Capodistria sono:
