L’église aurait été construite par une confrérie de marins.

Saint Nicolas étant le saint patron des marins et des pêcheurs, l’église était essentiellement fréquentée par des marins et leurs familles.

Bien qu’une plaque marquée de la date 1594 se trouve sur la façade de l’église baroque, celle-ci serait plus ancienne.

Une copie de l’œuvre de Carpaccio, la Vierge et l’Enfant sur un trône, orne cette église, l’original étant dans la cathédrale.