A folyó kb. 30 kilométer hosszú. Szlovénia és Horvátország határfolyója, és természetes összeköttetés a karszt-fennsík, az isztriai flysch és az Adria között.
Mellékfolyóival együtt vízeséseket, zubogókat, sziklaodvakat, medencéket és kanyargókat alkot. Megér egy látogatást a szlovén Isztria legmagasabb vízesése, a Trebeš melletti vízesés is.
A völgy alsó részén, a tengerbe torkollásnál, a Dragonja síkságot hozott létre, ahol Sečovlje sós mocsarai képződtek.
A folyómenti lejtőkön olajfaligetek, szőlőültetvények láthatók, és számos más növény és állatfaj él, amelyek alkalmazkodtak a folyó sajátos „ritmusához”.
A Dragonja völgyében egykor mintegy 40 malom működött. Ma már csak a restaurált Kodarin-malom (Koštabona alatt) és a Mazurin-malom (Trsek alatt) látható, néhány más malom maradványai mellett.
